玉米镰孢顶腐病主要引起玉米幼苗顶端组织变褐色坏死，严重时影响成株的生长，病菌的侵染发生在植株大喇叭口内的幼嫩尖端，引起叶片伸出后在尖端出现腐烂坏死，或顶叶扭曲畸形，但腐烂组织不具有臭味；发病部位有时因腐烂而出现缺刻，病株叶片出现黄色条纹，植株矮小；若叶片顶端腐烂组织快速失水变干，可能导致多个叶片尖端粘合在一起，影响植株生长。
玉米品种间对镰孢顶腐病存在抗性差异，可以选择种植田间发病轻的品种。在玉米镰孢顶腐病易发地区，应减少秸秆还田，以压低土壤中的菌源。秋季收货后及时深翻灭茬，促进病残体分解。在田间病害发生较重时，可以喷施杀菌剂进行控制，如50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或80%森锰锌可湿性粉剂500倍液，有一定的防治效果。
